Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CQ90 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQ90 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms