Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms