Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg3Q9CPX6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms