Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cox6cQ9CPQ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cox6cQ9CPQ1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cox6cQ9CPQ1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cox6cQ9CPQ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cox6cQ9CPQ1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cox6cQ9CPQ1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms