Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms