Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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