Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rrbp1Q99PL5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rrbp1Q99PL5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms