Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4rQ99PI8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4rQ99PI8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms