Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms