Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sf3b1Q99NB9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b1Q99NB9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms