Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acss1Q99NB1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms