Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcgf6Q99NA9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms