Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp26Q99MX1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp26Q99MX1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp26Q99MX1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms