Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbc3Q99ML1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbc3Q99ML1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbc3Q99ML1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbc3Q99ML1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbc3Q99ML1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bbc3Q99ML1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bbc3Q99ML1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bbc3Q99ML1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bbc3Q99ML1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bbc3Q99ML1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms