Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms