Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rwdd2bQ99M03 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rwdd2bQ99M03 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms