Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms