Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcc1Q99LI2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcc1Q99LI2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms