Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpifQ99KR7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpifQ99KR7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PpifQ99KR7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PpifQ99KR7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpifQ99KR7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpifQ99KR7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpifQ99KR7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PpifQ99KR7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms