Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf19Q99KP6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms