Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clint1Q99KN9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms