Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Reep3Q99KK1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms