Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcf19Q99KJ5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tcf19Q99KJ5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.6 ms