Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps4Q99KG7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms