Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlgn1Q99K10 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlgn1Q99K10 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms