Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lims1Q99JW4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms