Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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Smim11aQ99J19 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Smim11aQ99J19 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Smim11aQ99J19 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Smim11aQ99J19 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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Smim11aQ99J19 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Smim11aQ99J19 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Smim11aQ99J19 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Smim11aQ99J19 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Smim11aQ99J19 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Smim11aQ99J19 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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