Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc8b1Q925Q3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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