Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmo1Q924W9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Lmo1Q924W9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Lmo1Q924W9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Lmo1Q924W9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmo1Q924W9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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