Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripply3Q924S9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms