Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Letmd1Q924L1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Letmd1Q924L1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms