Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms