Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms