Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrif1Q923B3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms