Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb6Q922F4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms