Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf3Q920N1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf3Q920N1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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