Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms