Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms