Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx4Q91YJ2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms