Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atl3Q91YH5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atl3Q91YH5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms