Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usb1Q91W78 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms