Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn8Q91VA3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms