Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf4Q8VI88 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms