Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHT7

Gtf3a, Transcription factor IIIA, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3aQ8VHT7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3aQ8VHT7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms