Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms