Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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