Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BbxQ8VBW5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BbxQ8VBW5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms