Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ApobrQ8VBT6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApobrQ8VBT6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ApobrQ8VBT6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms