Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top1mtQ8R4U6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Top1mtQ8R4U6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Top1mtQ8R4U6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Top1mtQ8R4U6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1mtQ8R4U6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1mtQ8R4U6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms