Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp3Q8R4B8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp3Q8R4B8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms